Исследователи из проекта «100 000 геномов» разработали алгоритм PRRDetect, который позволяет эффективно выявлять уязвимые опухоли, что может существенно улучшить лечение рака. Этот инструмент, сравнимый с «металлоискателем», анализирует полную ДНК опухолей, помогая прогнозировать, как они могут реагировать на лечение.
Процесс разработки алгоритма был основан на анализе данных 4775 опухолей различных типов рака, полученных в рамках проекта. Исследователи обнаружили, что опухоли с дефектами в ДНК, известные как дисфункция пострепликативного восстановления (PRRd), более чувствительны к иммунотерапии, что открывает перспективы для создания персонализированных планов лечения.
Алгоритм PRRDetect может помочь врачам определить, у каких пациентов с высокими шансами на успешное лечение следует применять иммунотерапию, что позволит улучшить выживаемость и повысить эффективность лечения рака. Этот инструмент может также привести к более точному прогнозированию заболеваний, таких как рак кишечника, мозга, кожи, легких и других.
Изучение мутаций «индел» в ДНК, которое стало основой для создания алгоритма, позволило выявить 37 различных моделей мутаций, некоторые из которых связаны с известными причинами рака, такими как курение и ультрафиолетовое излучение.